Учёный-физик, академик РАН (2008).
Основные исследования в области лазерной физики, рентгеновской оптики, физики тонких плёнок и высокотемпературной сверхпроводимости.
С 1993 – 2009 гг. – директор института физики микроструктур Российской академии наук.
Государственная премия СССР (1990).
В Российском государственном архиве в г. Самаре на постоянном хранении находятся заявочные материалы на изобретения Гапонова С.В. (Ф. Р-1).
Перечень этих документов представлен в базе данных «Патентный каталог».
Подробнее с документами и базой данных можно ознакомиться в читальном зале архива по адресу: г. Самара, ул. Мичурина, д. 58.